IUCN收录为极危物种。

1989年，镇海棘螈被列为国家二级重点保护野生动物。

为拯救中国这一特有珍稀濒危物种，中国科学院于1996年将“镇海棘螈繁殖行为学研究”列入科学院“九五”重大项目“中国特有濒危脊椎动物繁殖行为生态学研究”中，同时，宁波市北仑区科委也以“镇海棘螈保护生物学研究”为题进行了专项支持。通过中国科学院成都生物研究所，浙江省自然博物馆和北仑林场三方的长期合作对该螈的生存现状和具体保护策略的研究，对该珍稀物种的种群数量、遗传结构、繁殖行为、个体发育和保护生物学等方面以及该物种的濒危现状、保护意义和濒危的内、外机制有了更加深入的认识。为加强对镇海的保护与研究，设立棘螈自然保护区。北仑林场自1996年以来为保护该物种也投入了力和财务。阪岙一带的繁殖区域内砍掉了70多亩桔树，并种上了大批的树木。对镇海棘螈生长活动的150亩范围内实行全封闭，不准治虫、施肥，车人不得进入。拍摄了《神秘濒危的两栖动物——镇海棘螈》、《追寻镇海棘螈》电视专题片，加强人们对该物种的了解和保护意识。